SIA FTP Database

Sistema de Informações Ambulatoriais

[1]:

from pysus.ftp.databases.sia import SIA
sia = SIA().load() # Loads the files from DATASUS

[2]:

sia

[2]:

SIA - Sistema de Informações Ambulatoriais

[3]:

sia.metadata

[3]:

{'long_name': 'Sistema de Informações Ambulatoriais',
 'source': 'http://sia.datasus.gov.br/principal/index.php',
 'description': 'O Sistema de Informação Ambulatorial (SIA) foi instituído pela Portaria GM/MS n.º 896 de 29 de junho de 1990. Originalmente, o SIA foi concebido a partir do projeto SICAPS (Sistema de Informação e Controle Ambulatorial da Previdência Social), em que os conceitos, os objetivos e as diretrizes criados para o desenvolvimento do SICAPS foram extremamente importantes e amplamente utilizados para o desenvolvimento do SIA, tais como: (i) o acompanhamento das programações físicas e orçamentárias; (ii) o acompanhamento das ações de saúde produzidas; (iii) a agilização do pagamento e controle orçamentário e financeiro; e (iv) a formação de banco de dados para contribuir com a construção do SUS.'}

[4]:

sia.groups

[4]:

{'AB': 'APAC de Cirurgia Bariátrica',
 'ABO': 'APAC de Acompanhamento Pós Cirurgia Bariátrica',
 'ACF': 'APAC de Confecção de Fístula',
 'AD': 'APAC de Laudos Diversos',
 'AM': 'APAC de Medicamentos',
 'AMP': 'APAC de Acompanhamento Multiprofissional',
 'AN': 'APAC de Nefrologia',
 'AQ': 'APAC de Quimioterapia',
 'AR': 'APAC de Radioterapia',
 'ATD': 'APAC de Tratamento Dialítico',
 'BI': 'Boletim de Produção Ambulatorial individualizado',
 'IMPBO': '',
 'PA': 'Produção Ambulatorial',
 'PAM': '',
 'PAR': '',
 'PAS': '',
 'PS': 'RAAS Psicossocial',
 'SAD': 'RAAS de Atenção Domiciliar'}

Getting specific files

[5]:

print(str(len(sia.get_files(["PA", "BI"]))) + " files")

14300 files

[6]:

sia.get_files("PA", uf="SP", year=2000)

[6]:

[PASP0001.dbc,
 PASP0002.dbc,
 PASP0004.dbc,
 PASP0005.dbc,
 Pasp0006.dbc,
 pasp0003.dbc,
 pasp0007.dbc,
 pasp0008.dbc,
 pasp0009.dbc,
 pasp0010.dbc,
 pasp0011.dbc,
 pasp0012.dbc]

[7]:

files = sia.get_files("PA", uf="SP", year=2000, month=[1,2])
files

[7]:

[PASP0001.dbc, PASP0002.dbc]

Describing files inside DATASUS server

[8]:

sia.describe(files[0])

[8]:

{'name': 'PASP0001.dbc',
 'group': 'Produção Ambulatorial',
 'uf': 'São Paulo',
 'month': 'Janeiro',
 'year': 2000,
 'size': '7.2 MB',
 'last_update': '2013-10-24 04:18PM'}

Downloading files

You can rather download multiple files or download them individually:

[9]:

sia.download(files) # or specify a directory with `local_dir=`

PASP0002.parquet: 100%|████████████| 447k/447k [00:20<00:00, 21.6kB/s]

[9]:

[/home/bida/pysus/PASP0001.parquet, /home/bida/pysus/PASP0002.parquet]

@Note: If the file has been downloaded already, it’s required to delete it in order to download the lastest updated file from DATASUS.

Reading files

PySUS uses Parquets as output, use the method to_dataframe() to read the file as pandas DataFrame

[10]:

parquet = sia.download(files)[0]

100%|████████████████████████████| 7.73M/7.73M [00:00<00:00, 4.84GB/s]

[11]:

parquet.to_dataframe()

[11]:

	PA_CONDIC	PA_GESTAO	PA_CODUNI	PA_DATREF	PA_CODPRO	PA_DOCORIG	PA_CODESP	PA_TIPPRO	PA_TIPATE	PA_FXETAR	...	PA_DATPR	PA_VALPRO	PA_VALAPR	PA_UFMUN	PA_MUNAT	PA_NUMAPA	PA_CODOCO	PA_CIDPRI	PA_CIDSEC	PA_MORFOL
0	EC	359999	000867	200001	0701223	B	27	02	99		...	200001	58.65	58.65	355030	355030	00000000000	S01
1	EC	359999	000867	200001	0701223	B	27	02	99		...	200001	15.30	15.30	355030	355030	00000000000	S01
2	EC	359999	000867	200001	0701223	B	27	02	99		...	200001	12.75	12.75	355030	355030	00000000000	S01
3	EC	359999	000867	200001	0701223	B	27	02	99		...	200001	12.75	12.75	355030	355030	00000000000	S01
4	EC	359999	000867	200001	0701223	B	27	02	99		...	200001	5.10	5.10	355030	355030	00000000000	S01
...	...	...	...	...	...	...	...	...	...	...	...	...	...	...	...	...	...	...	...	...	...
725999	EA	359999	016127	200001	0102302	B	77	00	00		...	200001	3972.00	3972.00	355030	355030	00000000000	S01
726000	EA	359999	016127	200001	0302206	B	30	00	00		...	200001	2.48	2.48	355030	355030	00000000000	S01
726001	EA	359999	016127	200001	0302207	B	30	00	00		...	200001	6.39	6.39	355030	355030	00000000000	S01
726002	EA	359999	016127	200001	0304103	B	30	00	00		...	200001	7.92	7.92	355030	355030	00000000000	S01
726003	EA	359999	016127	200001	0401103	B	01	00	27		...	200001	2.00	2.00	355030	355030	00000000000	S01

726004 rows × 24 columns