Tutoriais

O PySUS inclui alguns notebooks Jupyter em seu pacote de distribuição para servir como tutoriais.

Trabalhando com a base de dados SINASC

SINASC é o registro nacional de nascidos vivos. Com o PySUS, você pode fazer o download direto das tabelas do SINASC e tê-las como dataframes para integrar em sua análise. Veja este notebook. https://github.com/AlertaDengue/PySUS/blob/master/pysus/Notebooks/Analyzing%20SINASC%20Data.ipynb

Trabalhando com arquivos SINAN

SINAN é o registro nacional de casos de doenças de notificação obrigatória. O PySUS oferece a possibilidade de baixar registros de casos individuais selecionados para investigação laboratorial adicional, não a totalidade dos casos notificados. Para saber como baixar esses dados, consulte o notebook de exemplo fornecido.

O módulo sinan no pacote de pré-processamento pode carregar arquivos SINAN do formato DBF, retornando um pandas DataFrame corrigindo a tipagem de algumas colunas.

Ele também oferece capacidades de geocodificação que atribuem coordenadas geográficas a cada caso notificado em um DataFrame do SINAN. Você pode usar sua chave API do Google para evitar os limites gratuitos do Google. Para isso, basta criar uma variável de ambiente chamada GOOGLE_API_KEY. Aviso: isso pode levar muito tempo! e pode parar no meio do caminho, devido a conexões expirando. Mas o PySUS sabe como reiniciar a partir do último endereço geocodificado. Veja este notebook. https://github.com/AlertaDengue/PySUS/blob/master/docs/source/SINAN.ipynb

Trabalhando com a base de dados SIH

SIH é o sistema de informações hospitalares do DATASUS e contém informações detalhadas sobre internações hospitalares. Os dados do SIH também podem ser baixados diretamente com o PySUS. Veja este notebook. https://github.com/AlertaDengue/PySUS/blob/master/pysus/Notebooks/Analyzing%20SIH.ipynb